24 июня 1930 года, Народным Комиссариатом путей сообщения был издан Приказ № 304-к, об образовании в г. Красноярске техникума водных путей сообщения.
Перед техникумом стояла задача – готовить средний командный состав по судоводительской, судомеханической и гидротехнической специальностям. Молодёжь края проявила большой интерес к новому учебному заведению: на 240 мест было подано 1500 заявлений.

В апреле 1933 годаКрасноярский техникум водных путей сообщения переименовывается втехникум речного транспорта. В мае–июне 1933 года состоялся первый выпуск командиров речного флота в количестве 119 человек, в том числе: 54 судомеханика–паротехника, 26 техников-судоводителей речного, озёрного и малого каботажного плавания, 20 судомехаников двигателей внутреннего сгорания, 19 техников речного транспорта по гидротехнической специальности.

В конце 1933 года старания директора техникума Михаила Семёновича Лавриненко увенчались успехом. Техникуму было выделено двухэтажное деревянное здание, в котором до этого было общежитие грузчиков Красноярского речного порта, по улице Просвещения,13. В этом доме было оборудовано 14 классов, небольшая библиотека, учительская и служебные кабинеты.

19 мая 1935 года пришел приказ Наркомата водных путей о переезде техникума в г.Минусинск. Начинается подготовительная работа. Приказом Наркомвода №355 от 17.08.1935 гидротехническое и радиотехническое отделения переводятся в Горьковский речной техникум. Тринадцать работников техникума подали заявления на увольнение в связи с нежеланием переезжать, десять из них уволилось. Директор М.С. Лавриненко выезжает в г.Минусинск на рекогносцировку. Побывав на месте и убедившись в отсутствии надлежащих условий для успешной деятельности техникума в г.Минусинске, он выезжает в Наркомвод и доказывает нецелесообразность перевода на новое место. Техникум остался в Красноярске.

9 мая 1943 годаречной флот, в том числе и Красноярский речной техникум, переводят на военное положение.

В сентябре 1943 года в техникуме открываются два новых отделения: радиотехническое и судостроительное. Радиотехническое отделение в июне 1944 года было ликвидировано, а студенты этого отделения были переведены на другие специальности.

В годы Великой Отечественной войны многие выпускники и студенты техникума принимали непосредственное участие в борьбе с немецко-фашистскими войсками, проявляя при этом мужество и героизм. Они насмерть стояли у стен Москвы и Сталинграда, защищали блокадный Ленинград, героически сражались на Орловско-Курской дуге, на Днепре, в Белоруссии и на Украине, участвовали во взятии Кенигсберга и Берлина. Встречались с фашистами в открытом морском бою и на рейде о. Диксон.
В память о студентах техникума, павших в боях за Родину в годы Великой Отечественной войны, на территории училища воздвигнут обелиск.

В сентябре 1949 годав Речной техникум в качестве пополнения были приняты 52 учащихся Красноярского техникума сельскохозяйственного машиностроения в связи с его ликвидацией. Из них была скомплектована последняя группа по специальности «Речное судостроение и ремонт» с двухгодичным сроком обучения.

12 сентября 1955 годаМинистр речного флота СССР Шашков издал приказ № 355 «Ореорганизации Пеледуйского арктического судостроительного училища в Красноярское речное училище». Этим же приказом предписывалось Енисейскому речному пароходству доставить выделенные с Енисейской судоверфи 3 восьми квартирных дома из Енисейска в Красноярск для речного училища.

С 1 января 1956 годаКрасноярский речной техникум стал именоватьсяКрасноярским речным училищем. Вскоре утверждено штатное расписание цикла военно-морской подготовки, расширен штат педагогических работников. В училище вводятся должности замполита, заместителя начальника по военно-морской подготовке, инструктора культмассовой работы, инженера-строителя.

7 января 1961 годакурсанты переселились в новое здание общежития по адресу переулок Якорный, 3. С этого момента начались и занятия в новых учебных классах.
По завершению строительства при входе основного корпуса, на крыльце, были установлены якоря. Поэтому, после обсуждения в коллективе наименования переулка, по предложению И.С. Корякина, было направлено письмо в исполком Горсовета с просьбой назвать переулок Якорным. Просьбу исполком удовлетворил, с тех пор и существует «Якорный», а само здание училища среди красноярцев получило неофициальное название – «Дом на якорях».

В апреле 1961 годаотменяется спец. подготовка в училище.

С 28 апреля 1987 года, в соответствии с Постановлением Совета Министров РСФСР № 128 от 28 марта 1986 г., в училище введено ношение наплечных знаков.

В 1988–1989 гг. ведётся активное переоборудование, модернизация учебных лабораторий и кабинетов. Создаются лаборатории радиосвязи, электротехники и электроники, судовой электро-автоматики и судового электрооборудования.

3 января 1991 года, Министерство речного флота переименовывает Красноярское речное училище вКрасноярское командное речное училище.

29 декабря 1992 годаКрасноярское детское речное пароходство принимается в состав училища в качестве структурного подразделения.

6 мая 2000 годав торжественной обстановке коллективу училища вручено новое знамя Андреевский флаг с нанесенной в центре, на пересечении голубых полос, геральдикой нашего учебного заведения.

9 мая 2000 годав городе Красноярске впервые проводился парад воинских частей Красноярского гарнизона, посвященный 55-летию Победы над гитлеровской Германией. Коллектив училища был удостоен чести принимать участие в этом параде.
Подготовка курсантов к Параду получила высокую оценку со стороны губернатора Красноярского края А.И. Лебедя. Курсантам и работникам – участникам парада была объявлена благодарность. В последующие годы курсанты также принимали участие в парадах наравне с войсками Красноярского гарнизона.

В сентябре 2005 годазакончено строительство нового здания благоустроенного общежития для курсантов училища.

Распоряжением Правительства № 1625 от 7 октября 2005 года, училище вошло в состав Новосибирской государственной академии инженеров водного транспорта, в качестве филиала.
И распоряженим №АД-291-р Федерального агенства морского и речного транспорта было переименовано в
Филиал ФГОУ ВПО "Новосибирская государственная академия водного транспорта" Красноярское командное речное училище"

20 ноября 2006 года,приказом №38 Федерального агенства морского и речного транспорта,Красноярское командное речное училище получило статус вуза и было переименовано в Енисейский филиал ФГОУ ВПО "Новосибирская государственная академия водного транспорта" (в г. Красноярске)

23 марта 2011 года,распоряжением №АД-51-р Федерального агенства морского и речного транспорта, Ениссейский филиал был переименован вКрасноярский институт водного транспорта (филиал) ФГОУ ВПО "Новосибирская государственная академия водного транспорта"

Распоряжением Федерального агентства морского и речного транспорта №АП-7-р от 19 января 2015 года НГАВТ переименован в Сибирский государственный университет водного транспорта.
24 февраля 2015 года, приказом №45/общ. ФГБОУ ВО "Сибирский государственный университет водного транспорта",Красноярский институт водного транспорта (филиал) ФГОУ ВПО "Новосибирская государственная академия водного транспорта" был перименован в Красноярский институт водного транспорта - филиал ФГБОУ ВО "Сибирский государственный университет водного транспорта"